无人机工程师的专业课程主要有：无人机飞行原理、无人机组装与调试、无人机法律与法规、无人机系统导论、无人机动力技术、无人机操控应用技术、无人机系统维修与保养、无人机飞行控制技术、无人机运行气象知识等课程。