学历认证的具体起始时间没有明确的记载。

但是，根据资料分析，从 2001 年起，国家对高等教育学历证书实行电子注册制度。此外，从 2002 年以后毕业的大专或本科毕业证因为没有上网，需要做学历认证。因此，可以推断学历认证制度至少从 2001 年就已经开始实施。