两者的毕业证都是国家承认的专科学历，没有区别。

大专一批和二批是招生时录取的批次不同，一般来说，一批的分数线比二批要高。其原因主要是一批的师资、教学条件要比二批要好一点，因此报考的学生分数就高了。毕业证书没有本质的区别，都是大专毕业证书。