南京农业大学好，因为南京农业大学是211，扬州大学是省重点，不管是就业还是考研，学校的牌子始终是被关注的重点，很少有人计较你在学校所学的专业是什么排名，就这一点来说，当然选南农，但是扬州大学的兽医专业真的很好，应该比南农的好，南京城市大，高校多，经常有大的学术活动，就业机会也多，扬州相比就小很多。

南京大学是双一流985和211高校国家级当然好扬州大学是省属的略略差点

南京农业大学和扬州大学比较，两所大学都很好各有千秋，南京农业大学是211工程重点大学，同时也是教育部直属院校，建校历史悠久做为老牌名校已经建立形成了综合性农学理工科大学，扬州大学也很好，虽然不是211重点，但做为江苏省重点建设大学，已经形成了农医文艺理工科全面的综合性大学。