区别非常大，两者取得的学历不同。

本硕连读最终取得是硕士研究生学历，本硕博连读是指三种学历连着读完，最终取得的是博士研究生学历。两种学制都是在高中毕业时成绩非常好的学生才可能录取这两种学制，当然本硕博的录取要求更高一些。

本硕连读指的是读啦本科就直接读研究生。本硕博连读指的是读啦本科再读研究生，读啦再读博士。