最大的区别是齐鲁交通学院是山东大学的一个学院，不是独立的院校。

山东交通学院是独立的一所省属院校。相关情况如下：

1、齐鲁交通学院是山东大学与山东高速集团联合共建的一个学院。学院下设交通工程系、城市与地下空间工程系及前沿交叉研究中心。拥有3个博士学术学位授权点 5个硕士学术学位授权点，2个专业型学位授权点，2个本科专业。

2、山东交通学院位于济南市，是中华人民共和国交通运输部与山东省人民政府共建高校。学校占地面积3200余亩，有长清校区、无影山校区、威海校区、东校区4个校区；设有19个学院（部），开设57个本科专业和交通运输、机械2个硕士专业。

山东交通学院是一个普通二本，齐鲁交通学院是山东大学和齐鲁交通发展集团共建的。