首先，海源学院与曲靖医专的办学性质不同，一个是公办，一个是民办，合并起来有难度。

其次，海源学院与曲靖医专研究方向不同，没有共同点。最后，海源学院与曲靖医专发展方向也不同。

经过查阅相关资料，我们可以知道，海源学院不与曲靖医专合并是因为海源学院没有转公办，而是直接转成民办院校。随着政策的调整，独立学院要么转为公办，要么转为民办。