新乡医学院菁英班和普通班的主要区别在于学习质量和教学方法。

菁英班是面向全国招生的高水平班级，招收的是学习成绩优秀、综合素质较高的学生。相对于普通班，菁英班的教学质量更高，教师力量更强，课程设置更加严格，学习内容更加深入。此外，菁英班还注重培养学生的创新能力、实践能力和团队协作能力，提高学生的综合素质。普通班则是面向全省招收的普通班级，学生的招收标准相对较低，学习内容和教学质量也较为一般。但是，普通班的学习方式更灵活，学生可以自由选择课程，有更多的时间来参加社会实践和其他活动。总体而言，菁英班和普通班的教学目标和教学方式有所不同，适合不同层次和需求的学生。