行政在职就是行政机关的在编职工，而事业在职就是事业单位的在编职工，本质区别在于行政在职是属于公务员，而事业在职是一般工作人员。

行政在职与事业在职还有收入待遇和职务升迁的区别，行政在职收入要高于事业在职，职务有上升的空间。