吉林工业大学和吉林大学合并的原因是为了提高学校的办学水平和教育质量，加强学科建设和科研实力，提升学校国际影响力和竞争力。

合并后，学校资源得以整合利用，共享师资和设施，提高学校整体教学和科研水平。同时，合并也有利于学校品牌的提升和学生专业选择的拓宽，为吉林省高等教育的快速发展提供更好的支持和保障。