南开大学研究生一共有39个学院。

南开大学研究生学院分别是陈醒生数学研究所，数学科学学院，统计局数据科学学院，物理科学学院泰达，应用物理研究院电子信息与光学工程学院人工智能学院，计算机学院网络空间安全学院软件学院，环境科学与工程学院，化学学院，材料科学与工程，学院生命科学学院，泰达生物技术研究院，药学院，医学院汉语言文化学院等等。