49年国立河南大学遭遇了国共内战的影响。

1. 国共内战期间，由于大陆东西两岸分裂，国立河南大学在未经过城市者控制的状态下，所遭遇的变故源于暴力、政治恐惧等因素；2. 在战争的阴影下，国立河南大学在经济资源紧张的情况下不得不关闭，很多师生因此丧失了正常的学习和工作机会；3. 如果不是当时国共内战之间的外部因素，国立河南大学本应该像其他国内大学一样得到更好的发展机会。

1949年国立河南大学一分为二，分为中原大学占30%的学生，迁往武汉。其余的国立河南大学的一部分并入河南科技大学，一部后来并入政法干校，另一部分迁到开封改为开封师院。