顺序不同、次数不同。

一、顺序不同1、模拟投档：在每批次正式投档前一天，省教育考试院按高校确定的投档比例进行模拟投档。

2、正式投档：各省教育考试院一般会在进行完模拟投档后，才进行正式投档。

二、次数不同1、模拟投档：模拟投档会有多次，会进行补充投档。

2、正式投档：正式投档只有一次，不进行补充投档。

一般的情况下第三次模拟投档和正式投档应该是一样的，因为是经过了你的反复思考和推敲得出来的答案，如果是推翻前面的结论，会产生后悔的想法。