福州大学的国家特色专业有：福建省物质科学与工程重点实验室、国家海洋局海洋动力过程与控制实验室、国家海洋局近海海洋环境科学与工程实验室、国家国际水研究中心福州基地、福建省分子药理学重点实验室、福建省生物化学与药物创制重点实验室、福建省中药精细化工技术研究重点实验室、福建省全民健身与竞技体育研究中心等。