华东交通大学王牌专业有土木工程、给排水科学与工程、电气工程及其自动化、自动化等专业。

电气学院和土木学院可以说是华交最好的学院，另外，机电、信息等学院也相当不错。

华东交通大学的自动化专业是比较好并且热门的专业，其包括自动化程序的没计，自动化控制装置，电器自市化等方面的专业知识，