生物医学工程好。

生物医学工程专业的就业前景是非常可观的。毕业生可在管理机构和国家机关，医学机构（临床研究、高度专业化的医学护理，管理） , 医疗器械企业，研究所，大学（基础研究，教学），国际制药企业、保健品企业（管理、研究和开发）任职，薪资待遇也很不错。

生物信息是培养生物、医学相关计算机人才，生物医学工程是培养今后医疗器械研发、维护人才，根据自己的爱好兴趣来定，两者没有可比性。

感觉是生物信息比较好吧，以下是BOSS直聘发布的《2019高校应届生专业就业竞争力观察》中的表格，在就业竞争力排名中，生物信息学占第6位，生物医学工程占第24位。根据周边同学的情况来看,似乎也是这样的,对生物信息学人员的需求量更大,待遇也更好一些。