学校前身是清朝光绪年间由湖广总督张之洞于1898年创办的湖北农务学堂。

几经演变，1952年，武汉大学农学院和湖北农学院的全部系科以及中山大学等6所综合性大学农学院的部分系科组建成立华中农学院。

1979年，经国务院批准列为全国重点大学，直属农业部。

1985年，更名为华中农业大学。

2000年，由农业部划转教育部直属领导。

2005年，进入国家“211工程”建设行列。

2017年，列入国家“双一流”建设行列。