南京体育学院在南京有两个校址，第一个在江苏省南京市玄武区灵谷寺8号，第二个在江苏省南京市栖霞区仙林大道169号，仙林大学城附近。

同时在栖霞区仙林大道还有一个五棵松校区正在筹建。还有在滨江还一个校区，主要是针对研究生培养！