两者区别表现在：

1、公司具有法人资格，经营部没有。

2、公司承担有限连带责任，经营部承担无限连带责任。

3、经营部的规模一般小于公司。

4、经营部需要缴纳个人所得税，公司缴纳企业所得税，两者税种不同，且一般公司所缴纳的税收种类更多，数额更大。