嘉应学院研究生专业如下：化学（国家级），汉语言文学（省级），生物科学（省级），思想政治教育（省级），美术学（校级），自动化（校级），财务管理（校级），计算机科学与技术（校级）。

省级战略新兴产业特色专业：计算机科学与技术（物联网工程方向），电子信息工程。 校级示范专业：土木工程，心理学，物理学，地理科学，生物工程。 省级应用型人才培养示范专业：土木工程。

嘉应学院研究生有工商管理、会计、教育学等专业。