有区别。

北京师范大学珠海分校的毕业证和北京师范大学本部的毕业证不是同一层次。前者是普通本科，后者为重点本科。珠海分校依托北师大的优质学科资源，着眼当代经济发展和社会需求，致力于培养具有宽厚人文、科学素养和学科专业知识的应用型专门人才。