一个合格的店铺商品损耗应该低于5%。

这是因为高损耗率会对企业的利润和形象造成负面影响。一方面，高损耗率会导致成本的增加，减少了商品销售带来的利润。另一方面，高损耗率也说明了店铺的管理和操作存在问题，降低了顾客对品牌的信任和满意度。因此，店铺应该加强对商品库存的管理，确保商品质量和保护顾客权益，同时提高店铺的效益和口碑。