建设工程的防雷管理部门有：住房城乡建设部门、气象部门、各专业部门。

具体按情况分类：

1、房屋建筑工程和市政基础设施工程防雷装置设计审核、竣工验收许可，整合纳入建筑工程施工图审查、竣工验收备案，统一由住房城乡建设部门监管，切实优化流程、缩短时限、提高效率。

2、油库、气库、弹药库、化学品仓库、烟花爆竹、石化等易燃易爆建设工程和场所，雷电易发区内的矿区、旅游景点或者投入使用的建（构）筑物、设施等需要单独安装雷电防护装置的场所，以及雷电风险高且没有防雷标准规范、需要进行特殊论证的大型项目，仍由气象部门负责防雷装置设计审核和竣工验收许可。

3、公路、水路、铁路、民航、水利、电力、核电、通信等专业建设工程防雷管理，由各专业部门负责。

防雷减灾工作由地方各级气象主管机构在上级气象主管机构和本级人民政府的领导下，负责组织管理本行政区域内的防雷减灾工作。

防雷检测由当地政府的气象局防雷办负责。所有的厂房和建筑物竣工后，都必须进行防雷检测，并由该部门出具检测报告。

气象部门负责管理，按照现在的规定，防雷检测资质由省级气象主管部门核发，业务培训由气象主管组织实施，防雷检测由气象主管监督。