制药工程和食品科学与工程两个专业都有不错的发展前景和就业机会。

制药工程专业学习制药技术和药品开发等内容，适合对医药行业兴趣的学生，就业方向包括制药公司、研发机构、医疗器械公司等。食品科学与工程专业学习食品加工、安全与营养等知识，适合对食品行业感兴趣的学生，就业方向包括食品加工企业、食品安全监管、研究机构等。根据个人兴趣和职业规划选择适合自己的专业。