安徽省内有一所中医药大学，也就是安徽中医药大学。

安徽中医药大学，校址省会合肥市，现有两个校区即梅山路校区和西校区。安徽中医药大学由原来安徽中医学院发展更名而来，中医学科汇聚了华佗故乡传统医学和新安医学，实力在全国中医药大学中排名较好。安徽中医药大学具有博士学位授予权，在安徽省内参与一本录取。

有安徽省中医药大学，安徽省中医药高等专科学校。另外安徽医科大学，皖南医学院等也开设中医系（院、部）。