这个就看从什么角度看了，两者都是双非本科院校，从科研水平上来看，都差不多。

从出生角度看，南京工程学院是几所部属老牌专科学校合并而成的，金陵科技学院是源自曾经的南京电大，这点上来看，金陵科技学院要低一些。从就业市场表现来看，南京工程学院远远强于金陵科技学院，每一年都有大量毕业生进入国家电网，这点金陵科技学院没有办法比。