自然由安全部门管理，这是安全部门的主要职责，档案是反映职责活动的原始记录，所以安全档案应由安全部门管理，而对企业有保存价值的安全档案在办理完毕后应向档案部门移交。

其实很多部门都有自己的安全档案，尤其是有独立的楼堂馆所建筑物的部门，它的安全档案应由行政办公室管理，或有安全管理职责的岗位管理