根据公开的数据，目前一建考试科目中通过率最低的门类是一建结构工程，通过率较低。

这是因为一建结构工程相对而言比较复杂，需要掌握大量的专业知识和技术，考核内容相对较难，因此通过率相对较低。不过需要注意的是，通过率可能会受到时间和地域的影响，在不同的时间和地点可能会有所变化。该答案基于目前公开数据，仅供参考。