基地学生除享有一般学生享有的全部权利外，国家和学校每年还拨专项基金数百万用于基地建设；学校设有专项基地奖学金（比如，学年优秀学业奖学金、基地困难生/特困生奖学金），专门奖励品学兼优的基地学生；学校将优先推荐基地优秀学生免试直升硕士研究生；并选送基地部分优秀学生到国外深造或攻读硕士学位。