山东交通学院一共有66个专业，其中本科专业有65个，专科专业有1个，其中国家特色专业包含：土木工程、交通运输、交通运输（轨道交通运营与管理），省级特色专业包含：土木工程、交通运输、市场营销、船舶与海洋工程、机械设计制造及其自动化、物流工程、车辆工程。