学院建有海洋技术系、生物工程系和食品科学与工程系等3个专业系；7个本科专业（方向）：海洋科学、海洋技术、水生动物医学、生物工程、食品科学与工程、食品质量与安全、农学（未招生），其中海洋技术专业2019年入选省一流本科专业，食品科学与工程专业2021年入选省一流本科专业，并获推参评国家一流本科专业。