签订日本留学协议通常涉及以下步骤：

申请日方院校留学资格

首先，你需要向日本的院校提交留学申请，并获得对方的入学通知书。这是申请留学签证的前提条件。

准备签证材料

签证申请书（贴照片）

护照

在留资格认定证明书（原件）及复印件1份

居住证等居住证明

户口簿复印件

誓约书（复印件2份），由日方接收企业或团体作成

确认书

提交签证申请

由于日本签证中心不接受个人递签，你需要将资料提交给授权的代办机构。这个过程需要一个工作日。

等待签证审核

提交申请后，签证审核一般需要4个工作日。在审核期间，请耐心等待。

获得签证

审核通过后，你将在8-10个工作日内收到签证。拿到签证后，就可以准备出发前往日本留学了。

建议你在签订留学协议前，仔细阅读协议内容，确保所有条款清晰明确，特别是关于费用、责任、退款等方面的规定。如果有任何疑问，建议咨询专业的留学顾问或律师。