日本大学留学的指导费用包括多个方面，具体如下：

日本语言学校

学校报名费：

1200~1800人民币左右。

学校学费：4万人民币左右。

国公立大学

大学报名费：约1800人民币。

学费：每年3-4万人民币。

私立大学

大学报名费：约1800人民币。

学费：普通文理科专业每年5万-8万人民币，艺术类、设计类专业每年8-10万人民币。

留学中介服务费用

一般在10000元左右。

文书费用：一般5000元左右，申请2-3所院校需15000元左右。

签证指导费用：大约2000元。

申请学校费：8000-50000元。

其他费用

学费定金和申请费：

10000到50000元。

境外服务费：大约3万元人民币。

综合以上费用，日本大学留学的总指导费用大约在 4万元到10万元人民币之间，具体费用根据学生选择的学校和专业、以及是否选择留学中介服务等因素而定。建议在选择留学机构和制定预算时，详细了解各项费用，以确保留学过程的顺利进行。