留学毕业回国后，档案可以存放在以下几个地方：

户籍所在地的人才交流中心

这是比较常见的选择，方便回国后办理相关手续。

毕业院校

有些学校可以为毕业生暂时保管档案一定时间，这通常适用于在毕业后的两年择业期内或即将启程出国深造的毕业生。

教育部留学服务中心

专门为留学人员提供档案管理等服务，是推荐的方式之一。回国后办理学历认证、就业报道、转档或存档等手续都会比较方便。

建议

对于打算在北京工作或落户北京的学生，建议将档案存放在北京的教育部留学服务中心，这样办理手续会更加方便。

如果毕业后打算立刻出国或需要一段时间gap year，建议先将档案存放在户籍地的人才市场，出国前再转入教育部留学服务中心。

如果回国后不打算在北京工作，可以通过邮寄或委托人的方式将档案转入或转出教育部留学服务中心，不需要亲自到北京办理。

综合考虑， 教育部留学服务中心和 户籍所在地的人才交流中心是较为理想的存放选择，具体选择哪个机构可以根据个人的就业计划和需求来决定。