选择上海日本留学申请的学校时，你可以从以下几个方面进行考虑：

学校综合排名

参考国际排名如QS世界大学排名、英国泰晤士高等教育THE（Times Higher Education）联合日本Benesse集团的“世界大学排名（日本版）”等。

考虑学校的知名度、历史背景和学术声誉。

专业实力

根据自己的兴趣和职业规划，选择专业实力强的学校。例如，教育学专业可以关注大阪大学，商科类可以关注一桥大学，物理光学类可以关注东京农工大学。

注意学校是否有特定专业的优势和研究方向。

地理位置

考虑学校所在城市的生活成本、交通便利性和就业机会。东京、大阪和京都等大城市通常提供更多的工作和实习机会。

经济状况

根据自己的经济能力选择合适的学校。国公立大学学费减免力度大，但竞争激烈；私立大学学费较高，但可能提供更多的奖学金和资助。

考虑学校的奖学金政策和兼职机会，以减轻经济负担。

语言要求

了解学校的语言要求，如托福、雅思成绩或其他语言考试。

考虑自己的语言水平，确保能够达到学校的入学标准。

学校特色

了解学校的特色课程、师资力量和国际学生比例，这些因素有助于提高学习效果和扩大语言环境。

个人兴趣和目标

明确自己的留学目标，是为了深造专业知识还是开拓国际视野。

考虑自己的兴趣和能力是否与所选专业相匹配，确保能够充分发挥自己的潜力。

教授研究方向

对于研究生申请，关注教授的研究方向和项目，选择与自己研究课题相匹配的教授。

学校排名

参考学校排名，了解学校的整体层次和录取难度。

申请材料准备

准备好所需的申请材料，如成绩单、推荐信、个人陈述等。

通过以上几个方面的综合考虑，你可以选择出最适合自己的日本留学申请学校。建议你可以参加一些留学说明会或咨询专业的留学顾问，以获得更详细和个性化的建议。