东南大学和北京理工大学都是中国著名的高等学府，各自有着不同的优势和特色，因此很难一概而论哪个更好。

以下是两所学校的一些特点和比较：

1. 学科专业：东南大学和北京理工大学在学科专业方面都有较强的实力，如东南大学的建筑、土木工程、交通运输等学科在国内享有较高的声誉，而北京理工大学的工程、科技、计算机等学科也很有特色。

2. 科研实力：东南大学和北京理工大学在科研方面都很强，拥有众多的科研团队和实验室，如东南大学的建筑设计研究院、智能制造技术研究所等，而北京理工大学的先进车辆技术研究院、微电子技术研究中心等也很有名气。

3. 学校声誉：两所学校在学术界和工业界都有着很高的声誉，但根据不同的评估标准可能会有所不同。比如在某些学科领域方面，东南大学可能更擅长，而在其他领域，北京理工大学可能更具有优势。

4. 地理位置：东南大学位于江苏省南京市，北京理工大学位于北京市，两所学校所处的城市环境和地域特色也不同，可以根据个人的喜好和发展方向进行选择。

综上所述，无法简单地判断哪个学校更好，应该根据个人的兴趣、专业倾向、发展方向等因素进行选择。