异地就医药品双通道备案流程如下：

1. 申请备案：申请人需向省级药品监管部门提交申请备案材料，包括药品注册证书、生产批件、检验报告、使用说明书等。

2. 审核：省级药品监管部门对申请材料进行审核，审查药品是否符合相关法律法规和技术标准的要求。

3. 颁发备案证书：审核通过后，省级药品监管部门颁发备案证书，并将药品信息录入国家药品监督管理局的药品信息数据库中。

4. 上报国家药品监督管理局：省级药品监管部门将备案信息上报国家药品监督管理局，以便在全国范围内进行统一管理和监管。

5. 更新信息：药品生产企业需及时向省级药品监管部门更新药品信息，包括生产、销售、使用情况，以便进行跟踪管理和风险评估。

6. 监督检查：省级药品监管部门会定期对备案药品进行监督检查，确保其质量和安全性符合要求。