日本在土木工程领域表现突出的学校包括：

东京大学：

土木工程专业在全球和国内排名中均位居前列，提供广泛的土木工程专业方向，包括土木技术与设计、水圈环境、管理等。

京都大学：

同样在土木工程领域享有盛誉，其工学研究科中的社会基盤工学专业和城市社会工程专业涵盖了土木工程的多个方面。

东京工业大学：

以工程技术与自然科学研究为主，土木工程专业设置在环境·社会理工学院，课程内容全面，并自2019年起提供英文授课。

以上排名基于不同时间点的发布信息，具体情况可能会有所变化。建议查看最新的教育评估报告或官方网站以获得最准确的信息