2024年长崎有以下大学：

1.  长崎大学

位于日本长崎县长崎市，是日本历史最悠久的公立医学校，由多个学校于1949年合并而成。设有教育学部、经济学部、医学院、工程学院、环境科学院等10个学部（学院），另设有8个研究生院。现有学生约9,277人，教职工3,288人。在2024年QS世界大学排名中位列日本第21名。

2.  长崎县立大学

公立大学，位于长崎县长崎市，是长崎县内主要的公立高校之一。

3.  长崎玉成短期大学

公立短期大学，位于长崎县长崎市。

4.  长崎女子短期大学

公立短期大学，位于长崎县长崎市。

5.  长崎短期大学

公立短期大学，位于长崎县长崎市。

6.  活水女子大学

私立大学，位于长崎县长崎市。

7.  长崎卫斯理公会大学

私立大学，位于长崎县长崎市。

8.  长崎国际大学

私立大学，位于长崎县长崎市。

9.  长崎纯心大学