中国暂停日本赴华留学签证的原因可以归结为以下几点：

对等反制措施：

由于日韩两国对中国入境游客实施了歧视性入境限制，包括要求提交核酸阴性证明、落地后统一核酸检测，以及分发不同颜色的标识（如黄牌和红牌），中国采取了暂停审发日本公民赴华普通签证作为对等反制措施。

疫情防控考虑：

中国放开国境后，为了疫情防控，对入境人员提出了更严格的隔离要求，如检测呈阳性者需隔离5-7天，这可能影响了日本留学生对赴华留学的意愿和计划。

签证政策调整：

中国取消了赴华签证申请的在线预约服务，并预测未来可能会恢复免签政策，这可能意味着对赴日留学的签证政策有所调整，虽然留学签证免签的可能性不大，但日本推行“40万留学生计划”表明其欢迎留学生。

外交关系考量：

中国可能基于外交关系的变化，对日本的入境政策作出相应调整。

以上信息综合了不同时间点的报道和官方声明，以提供全面的背景。