在南京选择日本出国留学机构时，可以考虑以下几家：

南京新东方前途出国：

新东方前途出国咨询有限公司是新东方旗下从事出国留学服务的专职机构，业务范围涵盖广泛，包括考试指导、留学规划、学校申请、签证服务等“一站式”留学服务。该机构综合实力强，师资力量雄厚，口碑较好。

南京樱花国际日语：

樱花国际日语主要专注于日语培训，成立时间较长，课程质量高，深受学生好评。该机构以专业的日语教学闻名，适合计划在日本学习日语的学生。

南京新航道教育：

新航道留学根据学生的个人情况和留学要求，提供最贴心、最针对性的留学方案和服务。该机构在行业内享有较高的声誉，学习理念先进。

南京启德教育：

启德教育提供全方位的留学服务，包括考试指导、学校申请、签证服务等，以专业的服务和良好的口碑著称。

南京芥末留学：

芥末留学专注于留学规划和申请，提供个性化的留学方案，深受学生和家长的认可。

南京金吉列留学：

金吉列留学拥有丰富的留学经验和专业的顾问团队，能够为学生提供高质量的留学服务。

南京新通教育：

新通留学为学生提供行前准备及海外就学期间的协助服务，是一家专业的留学服务机构。

南京朗阁教育：

朗阁教育拥有全国留学方案团队，专业为学生量身定做符合学生的留学计划。

南京朝日教育：

朝日教育在留学服务方面有着丰富的经验和良好的口碑，适合不同需求的学生。

南京新申途留学：

新申途留学提供全面的留学服务，包括考试指导、学校申请、签证服务等，以高性价比著称。

建议

综合考虑：在选择留学机构时，建议综合考虑机构的办学规模、师资力量、学费口碑等因素，选择最适合自己的机构。

实地考察：如果条件允许，可以亲自去机构实地考察，了解机构的教学环境和设施。

咨询前辈：可以向已经留学过的同学或朋友咨询，了解他们的实际体验和推荐。

通过以上信息，相信你可以选择到最适合自己的南京日本出国留学机构。