南京日本留学机构的费用大致如下：

中介服务费

一般在1万元人民币左右。

部分中介机构费用在20000元-60000元之间，提供包括留学申请指导、口语提升等服务。

境外服务费

大约需要支付3万元人民币。

这部分费用可能包括住宿安排、接机服务和生活指导等。

其他费用

申请学校费一般在8000-50000元之间，用于中介公司代表学生向海外院校申请学位。

签证指导费一般在1000-3000元之间，用于中介公司指导学生如何准备签证材料和面试。

文书费一般在2000-8000元之间，用于中介公司帮助学生撰写和修改申请材料。

选考料（报名费）和其他杂费因学校而异，通常在2万-3万日币之间，即1000-2000元人民币。

学费

语言学校学费大约为4.2-4.5万元/年，部分语言学校学费在70万日元左右，折合人民币约为40000元/年。

国立大学入场费28万日元（部分特定学生14万日元），约1W5,000元，每年学费56万日元，相当于3w多元。

私立大学入场费20w-35w日元（部分学生免），1w左右，2000-2w，文科70-90w日元，理科或文科4左右，医学部18w-18w左右。

大学院和上面基本一样，成本稍微少一点。

建议

选择留学机构：建议选择正规、有口碑的留学机构，确保服务质量和费用透明。

详细咨询：向留学机构详细咨询各项费用，包括学费、中介服务费、境外服务费等，以便做出更全面的预算。

综合考虑：除了费用外，还需考虑学校的地理位置、专业选择、生活成本等因素，综合评估留学方案的可行性。