关于日本留学补护照的费用，有以下信息可以参考：

普通护照补发费用 ：每本160元。

因私普通护照补发费用：

每本200元。

加急办理费用

6000日元（约合300元人民币）。

3000日元（约合150元人民币）。

建议：

如果时间允许，建议选择普通办理，费用为160元。

如果需要快速拿到护照，可以选择加急办理，费用约为300元人民币。

请根据个人情况和需求选择合适的办理方式。