一般贲门癌需要尽早发现，早期外科手术切除或者内镜下ESD手术，可以达到治愈的目的。部分中晚期的贲门癌可酌情选择放疗、化疗等治疗，尽可能延长患者的生命。贲门炎症的治疗主要需要饮食清淡，容易消化，不能饮酒、吸烟以及不进食辛辣食物，餐后不能立刻平卧，避免睡前两小时进食减少贲门部的炎症。口服奥美拉唑或雷贝拉唑抑制胃酸分泌，减轻炎症，口服依托必力促进食物排空。贲门失迟缓症患者可进行内镜下POME术。

常见的贲门疾病有贲门癌、贲门失迟缓症、贲门炎及贲门间质瘤等疾病。