首经贸红庙校区和本校的区别是位置不同、规模和设施不同、学院设置不同。

1、位置：首经贸红庙校区位于北京市朝阳区红庙地区，而主校区则位于北京市海淀区学院路，距离较远。

2、规模和设施：主校区是北京首都经济贸易大学的主要校园，规模较大，拥有更多的教学楼、学生宿舍、图书馆和其他学校设施。而红庙校区规模相对较小。

3、学院设置：主校区设有该大学的各个学院和部门，涵盖了经济学、贸易学、管理学、法学等多个学科领域。红庙校区可能更注重一些特定学科或专业。