新疆农业大学2021在全国本科院校排名第364位，强于第365名的信阳师范学院，第366名的河北经贸大学，第367名的宁波工程学院，第368名的绍兴文理学院，第369名的西安美术学院。在新疆排第5名，强于第6名的新疆财经大学，第7名的塔里木大学，第8名的喀什大学，第9名的新疆艺术学院，第10名的伊犁师范大学。

综合实力排名（校友会版）

新疆农业大学2021在全国本科院校排名第184位，强于第188名的青岛农业大学，第188名的青岛理工大学，第188名的东华理工大学，第191名的华东交通大学，第191名的西南科技大学。在新疆排第3名，强于第4名的新疆师范大学，第5名的塔里木大学，第6名的新疆财经大学，第7名的新疆工程学院，第8名的喀什大学。

综合实力排名（软科版）

新疆农业大学2021在全国本科院校排名第316位，强于第317名的常熟理工学院，第318名的天津城建大学，第318名的闽南师范大学，第320名的福建工程学院，第322名的五邑大学。在新疆排第4名，强于第5名的塔里木大学，第6名的喀什大学，第7名的伊犁师范大学，第8名的新疆工程学院，第9名的新疆理工学院。