山东中医药大学2021在全国本科院校排名第325位，强于第326名的吉首大学，第327名的青岛农业大学，第328名的云南农业大学，第329名的新疆医科大学，第330名的浙江科技学院。在山东排第19名，强于第20名的青岛农业大学，第21名的山东工商学院，第22名的临沂大学，第23名的德州学院，第24名的潍坊医学院。

综合实力排名（校友会版）

在全国本科院校排名第290位，在山东排第19名。

综合实力排名（软科版）

在全国本科院校排名第358位，在山东排第15名。