广州医科大学2021在全国本科院校排名第276位，强于第277名的浙江中医药大学，第278名的温州大学，第279名的南京工程学院，第280名的沈阳航空航天大学，第281名的内蒙古工业大学。在广东排第14名，强于第15名的广东财经大学，第16名的广东海洋大学，第17名的广东技术师范大学，第18名的广东药科大学，第19名的东莞理工学院。

综合实力排名（校友会版）

在全国本科院校排名第180位，在广东排第14名。

综合实力排名（软科版）

在全国本科院校排名第150位，在广东排第12名。