休斯敦市拥有众多高等教育机构，以下是部分知名大学列表：

莱斯大学 （Rice University）

私立研究型大学

“新常春藤”名校之一

1891年由威廉·马歇尔·莱斯创立

休斯顿大学 （University of Houston）

公立研究型大学

成立于1927年

提供广泛的学科，包括自然科学、财经、法律等

德克萨斯南方大学 （Texas Southern University）

公立历史黑人大学

主要服务于休斯顿地区的非洲裔和拉丁裔社区

休斯顿大学清湖分校 （University of Houston–Clear Lake）

公立大学

成立于1971年

休斯顿大学市中心分校 （University of Houston–Downtown）

公立大学

提供多样化的学位课程

贝勒医学院 （Baylor College of Medicine）

医学专业高等教育机构

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