中科院的研究所各有特色和优势，很难一概而论哪个研究所是“最好”的，因为这取决于评价的标准和具体的研究领域。不过，根据提供的信息，以下是一些在各自领域内具有显著成就和高度学术地位的研究所：

中国科学院上海分院：

位于上海，拥有多个有影响力的研究所。

中国科学院北京分院：

位于中科院总部所在地，汇聚了大量顶级科研人才。

中国科学院高能物理研究所：

在粒子物理、核物理等领域取得重要成果。

中国科学院自动化研究所：

在人工智能、机器人技术等领域处于国内领先地位。

中国科学院化学研究所：

在化学领域具有很高的学术地位，尤其在材料科学、催化等领域有显著成就。

中国科学院力学研究所：

在流体力学、固体力学等领域具有国际影响力。

中国科学院地球物理研究所：

在地球科学领域具有很高的学术地位，尤其在地震预测、地球动力学等方面有突出成果。

此外，上海有机所、长春应化所、大连物理化学研究所等也是各自领域内非常优秀的研究所。

选择哪个研究所最好，需要根据您的具体研究方向、兴趣以及职业发展规划来决定。建议您深入了解各个研究所的研究方向、成果、师资力量等，以便作出最适合自己的选择